 Le dossier de candidature au contrat doctoral 2017, ainsi que le dossier de candidature pour une activité complémentaire d'enseignement 2017 sont à demander uniquement par les Nantais





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2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : ANTIGNAC Jean-Philippe
% d'encadrement (minimum 40%) : 100
Mail du directeur de thèse : jean-philippe.antignac@oniris-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0240687880
Fax du directeur de thèse : 0240687878
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : USC INRA 1329 LABERCA
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Bruno LE BIZEC
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5.Financement acquis
Si oui, continuez la saisie, si non, passez directement à l'étape 7 : Non
Souhaitez vous mettre ce financement au concours de l'ED : Oui
6.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Les contaminants chimiques non persistants se caractérisent par un temps de demi-vie réduit dans l'organisme. En conséquence, leur mesure ponctuelle dans les fluides biologiques tels que le sang ou l'urine se heurte aux multiples sources de variabilité intra-individuelles et à une non représentativité des niveaux d'exposition à long terme. Matrice biologique alternative déjà largement utilisée dans le domaine de la médecine légale, le cheveu pourrait donner accès à une meilleure estimation d'exposition à moyen voir long terme. Si la démonstration de faisabilité est acquise pour plusieurs classes de contaminants, la famille des bisphénols est encore pratiquement inexplorée de ce point de vue. La mesure des bisphénols (composés parents) est déjà maîtrisée au LABERCA dans différentes matrices alimentaires et physiologiques (sang, urine). Le cheveu représente ici un nouveau compartiment pour appréhender cette caractérisation de l'imprégnation des populations aux bisphénols, et au-delà le lien « Environnement-Santé ». La recherche des formes natives mais également des formes métabolisées (métabolites de phase 1 et/ou de phase II conjugués), et leur validation en comparaison aux marqueurs présents dans les autres compartiments biologiques, seront au cœur de ce travail de thèse. Les prélèvements supports de l'étude sont en partie déjà disponibles (projet ANR Newplast coordonné par le LABERCA) et pour partie seront issu d'un programme Européen de biosurveillance à large échelle initié fin 2016 et dans lequel le LABERCA sera fortement impliqué (projet H2020 HBMI4EU). Les perspectives offertes par ce sujet se situent à la fois au plan technique (développement de nouvelles approches analytiques), scientifique (génération de nouvelles connaissances), de support aux politiques publiques (contribution à l'évaluation des risques sanitaires), et sociétal (de part le débat assez fort entourant la problématique des bisphénols dont le bisphénol A).
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : Non persistent organic chemicals are characterized by a reduced half-life in living organisms. Consequently, their measurement in biological fluids such as blood or urine is facing multiple sources of interindividual variability and a non representativeness of long term exposure. Alternative matrix already used in forensic, hair could give access to a better estimation of medium to long term exposure. If the feasibility is already demonstrated for several classes of contaminants, bisphenols remains largely unexplored from this point of view. The determination of bisphenols is already mastered at LABERCA for food and biological fluids (urine, milk and blood). Hair represents a new compartment for assessing this internal exposure of human to bisphenols, then the environment-health problematic. The research of parent compounds but also their metabolites (phase I and/or phase II conjugated), and their validation with regard to the markers detectable in other biological compartments, will constitute the core of the present PhD work. Samples supporting this project are partially already available (ANR research program Newplast coordinated by LABERCA), and will be also originated from a large scale European biomonitoring program (H2020 HBMI4EU) initiated end 2016 in which LABERCA will be strongly involved. Perspective offered by this work are both technical (innovative analytical developments), scientific (generation of new knowledge), support to public authorities (contribution to risk assessment), and societal (hot debate associated to the bisphenol issue).

1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Rôle du système immunitaire et de la graisse périvasculaire dans la relation Artèrio-Veineuse normale et pathologique
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : loufrani laurent
% d'encadrement (minimum 40%) : 100
Mail du directeur de thèse : laurent.loufrani@inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0660592509
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : BNMI INSERM1083 - CNRS6214
Nom et prénom du responsable du laboratoire : daniel henrion
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Laurent loufrani
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5.Financement acquis
Si oui, continuez la saisie, si non, passez directement à l'étape 7 : Non
6.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : La prolifération tumorale tout comme l'adaptation du système cardiovasculaire est accompagnée d'une adaptation du système sanguin dans le but de fournir un apport régulier en nutriments aux cellules. Cette adaptation se fait sous la forme d'une néoangiogénèse ainsi que d'une augmentation de débit sanguin au sein des artères et des veines. L'augmentation de débit sanguin au niveau du système tumoral va provoquer une adaptation des vaisseaux le composant et aboutissant in fine à un remodelage vasculaire. Les veines, toujours anatomiquement proches des artères laissent supposer une interaction artério-veineuse avec la participation des cellules circulantes comme les cellules de l'immunité ou de la graisse environante. La réponse inflammatoire engendrée par ce phénomène provoque un chimiotactisme des cellules immunitaires (monocytes, macrophages, polynucléaires neutrophiles et lymphocytes B et T) potentiellement impliquées dans le remodelage vasculaire et l'angiogenèse. Le but de ce stage est d'étudier l'implication de ces cellules immunitaires et de la graisse périvasculaire dans la collaboration artério-veineuse, processus essentiel de défense anti-tumorale et adaptative.

1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Implants polymériques fonctionnalisés pour le piégeage et l'élimination de cellules cancéreuses dans le glioblastome
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : BOURY Frank
% d'encadrement (minimum 40%) : 60
Mail du directeur de thèse : frank.boury@univ-angers.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0244688528
Le cas échéant
Nom et prénom du co-directeur (obligatoirement HDR) : Jerôme Christine
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : U892 CRCINA
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Grégoire Marc
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Garcion Emmanuel
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5.Financement acquis
Si oui, continuez la saisie, si non, passez directement à l'étape 7 : Non
6.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Le glioblastome (GBM) est une tumeur infiltrante du système nerveux central (SNC), au pronostic dramatique et pour laquelle le traitement actuel, consistant en une exérèse chirurgicale et une radiochimiothérapie, ne permet pas d’offrir au patient un bénéfice satisfaisant (médiane de survie inférieure à 16 mois). Dans le cadre de cette thèse, nous mettrons en place une stratégie loco-régionale permettant le piégeage sélectif des cellules de GBM en utilisant un système de guidage intelligent implantable. En collaboration avec le CERM (Université de Liège), nous développerons des polymères biodégradables à base de polyesters biodégrables et fonctionalisés de façon à rendre possible l’infusion loco-régionale des polymère et en parallèle la migration et la capture des cellules tumorales impliquées dans l’expansion du GBM. Ces polymères seront « processés » sous forme de fibres (procédé d'éléctro-spinning) ou de microsphères (procédés de formulation en milieu CO2 préssurisé) avant d'être implantés par stéréotaxie. Pour établir cette preuve de concept, le stromal cell-derived factor 1 (SDF-1 ou CXCL12) ligand du CXCR4 et pour lequel nous avons développé des modèles d’étude, sera particulièrement étudiée. Le rôle de SDF-1 dans la stimulation de la chimiotaxie de cellules de glioblastome a été largement décrit, tout en contribuant à l'agressivité de la tumeur et sa radiorésistance. Les modèles en 2D ou 3D des implants polymériques seront préparés soit seuls soit fonctionnalisés par des macromolécules d'adhésion. Nous évaluerons (i) la rugosité des surfaces, la quantification de protéine adsorbée en corrélation avec l'adhésion cellulaire (ii) Après formulation, l'efficacité de «scaffold» libérant SDF-1 sera évaluée initialement in vitro (matrigel) ou ex-vivo (coupes organotypiques) en amont d’analyses in vivo dans nos modèles de GBM chez le rongeur. In vivo, l’impact sur d’autres contingents cellulaires (eg. gliose, macrophages) sera également appréhendé.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Signalisation RhoA et athérosclérose
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : RhoA sigaling and atherosclerosis
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Gervaise Loirand
% d'encadrement (minimum 40%) : 100
Mail du directeur de thèse : gervaise.loirand@univ-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0228080116
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : Inserm U1087, Equipe 2
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Hervé Le Marec
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Gervaise Loirand
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5.Financement acquis
Si oui, continuez la saisie, si non, passez directement à l'étape 7 : Non
Souhaitez vous mettre ce financement au concours de l'ED : Oui
6.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : La voie de signalisation de la protéine G monomérique RhoA et son effecteur Rho kinase sont impliqués dans le développement de pathologies artérielles comme l'hypertension et l'athérosclérose. Nous avons démontré que la phosphorylation de RhoA sur la Ser188 par différentes serine-thréonine kinases contrôle négativement l'activité de RhoA. Cette phosphorylation joue en particulier un rôle majeur dans l'effet vasodilatateur du monoxide d'azote (NO) endothélial. Pour analyser les conséquences physiologiques de la phosphorylation de RhoA, nous avons généré un modèle de souris knock-in exprimant un mutant phosphomimétique de RhoA (S188E-RhoA). L'hypothèse que nous émettons est qu'in vivo, l'expression du mutant phosphomimétique de RhoA réduit l'activité de la voie RhoA/Rho kinase ; Les souris qui l'expriment devraient être, au moins partiellement, protégées des pathologies vasculaires impliquant l'activation de RhoA, en particulier l'athérosclérose. Pour tester cette hypothèse, nous avons produit des souris doublement transgéniques Ldlr-/--S188E-RhoA. L'objectif de ce projet est (i) d'analyser dans ce modèle le développement de l'athérosclérose induit par un régime riche en graisse et (ii) d'identifier les mécanismes moléculaires responsables des différences induites par l'expression de la forme phsophomimétique de RhoA. La réalisation de ce projet nécessite la mise en œuvre d'approches expérimentales multiples in vivo (expérimentation animale, microscopie intravitale, souris chimères (irradiation/greffe de MO,...) et in vitro (histologie, culture cellulaires, western blot, PCR, histologie...).

1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Mise en évidence d’une nouvelle voie de signalisation concernant la prolifération des carcinomes épidermoïdes bronchopulmonaires .

Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) :

Identified a new signaling pathway for proliferation of squamous carcinoma bronchopulmonary.

2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) :

ROUSSAKIS Christos
% d'encadrement (minimum 40%) : 100 ou 50 (à définir ultérieurement)
Mail du directeur de thèse : christos.roussakis@univ-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0643115298
Téléphone fixe du directeur de thèse : 0253484150

 3. Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : IICiMed-EA 1155
Nom et prénom du responsable du laboratoire : LE PAPE Patrice
Nom et prénom du responsable de l'équipe : ROUSSAKIS Christos
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)

5.Financement :

Possible
6.Projet de thèse (sera mis en ligne sur le site web de l'ED)

Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) :

Le projet du travail proposé pour cette thèse consiste à étudier les principales voies de signalisation voire de nouvelles voies activées, en utilisant la PCR quantitative d’un maximum de prélèvements post opératoires issus des patients atteints des carcinomes épidermoïdes « non à petites cellules. Les résultats de cette étude vont d’une part améliorer le traitement clinique et d’autre part cibler la recherche de nouveaux agents anticancéreux plus efficaces

1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Modélisation du développement préimplantatoire humain à partir de données de transcriptome de cellule unique
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : BOURDON Jérémie
% d'encadrement (minimum 40%) : 40
Mail du directeur de thèse : jeremie.bourdon@univ-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0251125825
OU
Nom et prénom du co-encadrant : DAVID Laurent
Mail du co-encadrant : laurent.david@univ-nantes.fr
Téléphone du co-encadrant : 0695556937
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : UMR1064
Nom et prénom du responsable du laboratoire : ANEGON Ignacio
Nom et prénom du responsable de l'équipe : ANEGON Ignacio
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5.Financement acquis
Si oui, continuez la saisie, si non, passez directement à l'étape 7 : Non
6.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : La fécondation in vitro (FIV) représente la meilleure chance d'avoir un enfant pour les individus infertiles, néanmoins son taux de succès cumulé n'est que de 27% en moyenne en Europe. Le succès de la FIV repose entre autre sur la qualité des embryons transféré, ce qui en terme de biologie du développement se traduit par la compréhension de la genèse des cellules pluripotentes au sein du blastocyste. Nous abordons cette problématique de deux façons : fondamentalement, en étudiant les mécanismes de régulation de la pluripotence ; cliniquement, en étudiant les caractères morphocinétiques associés à une naissance. Résultats préliminaires : Nous avons obtenus les résultats de RNA Seq de cellules uniques (450 cellules) et avons commencé l'analyse. Nos résultats préliminaires ont permis la découverte de nouveaux marqueurs spécifiques des lignées embryonnaires. Projet de thèse : Le projet consiste à modéliser le développement embryonnaire à partir des données transcriptomiques. La méthodologie est basée sur l'identification des gènes les plus informatifs associés avec chaque type cellulaire établi lors du développement préimplantatoire : les cellules de trophoblastes, les cellules de l'épiblastes (pluripotentes) et les cellules de l'endoderme primitif. A partir de ces signatures, nous reconstituerons l'arbre décisionnel le plus probable, c'est-à-dire la séquence d'acquisition des différents marqueurs par les cellules au cours du développement préimplantatoire, en les hiérarchisant. Nous étudierons ensuite les voies de signalisation activant ces marqueurs afin de proposer de nouvelles stratégies de culture supportant le développement préimplantatoire humain in vitro. Les méthodologies employées seront également utilisées pour l'étude des mécanismes de tolérance immunitaires à l'échelle de la cellule unique. Ces projets sont en cours d'élaboration à l'UMR1064.

1. Sujet

Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères):

Définition du potentiel thérapeutique des cellules souches adultes MuStem humaines dans le contexte des dystrophies musculaires
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