I. Liste des productions de l’umr 1347 Agroécologie Articles dans des revues internationales ou nationales avec comité de lecture





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12. Autres productions

12.1. Travaux encadrés : Thèses


2015

  1. Ait Lahmidi N. (2015). Sugar transport and partitioning during arbuscular mycorrhizal symbiosis (from basic to applied science). Thèse de Doctorat. Dijon. Université de Bourgogne. Directeurs de thèse: Wipf D., Berta G. IPM

  2. Grosjean K. (2015). Microdomaines ordonnés de la membrane plasmique végétale : Caractérisation et rôle dans la signalisation associée à la défense. Thèse de Doctorat. Dijon. Université de Bourgogne. Directrice de thèse: Simon-Plas F., Co-Directrice: Gerbeau-Pissot P. IPM

  3. Merlin C. (2015). Recherche de la signature biologique de la dégradation du chlordécone dans le sol des Antilles françaises. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences vie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Martin-Laurent F., Co-Encadrante : Devers M. 231p. EcolDur

  4. Ugarte Nano C. C. (2015). Etude de la variabilité des propriétés physiques et hydrodynamiques d’un sol argileux sous l’effet de conduites en protection intégrée contre les adventices. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la vie, Spécialités Science du sol Agronomie. Université de Bourgogne. Directeurs de thèse: Nicolardot B., Ubertosi M. 199p. EcolDur

2014

  1. Cazenave A.B. (2014). Réponse adaptative à court terme .de la fixation symbiotique du pois protéagineux à une ablation d’une partie des racines nodulées, en lien avec la disponibilité en assimilats carbonés. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la vie, Spécialité Ecophysiologie végétale. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Salon, C., Co-directrice: Voisin A.S. 334p. GEAPSI

  2. Constancias F. (2014). Distribution spatiale de la diversité bactérienne : de l'agrégat au paysage. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences Vie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Ranjard L., Co-encadrant: Chemidlin N. EcolDur (GenoSol)

  3. Essiane-Ondo O. (2014). Caractérisation d'une collection de variétés anciennes de blé pour leur aptitude à former les mycorhizes et impact sur la qualité des graines. Thèse de Doctorat, Sciences de la Vie, Spécialité Biologie Végétale. Université de Bourgogne. Directeurs de thèse : Wipf D., Gianinazzi S. 198p. IPM

  4. Gardin J. (2014). Caractérisation de la réponse transcriptionnelle du vulpin des champs (Alopecurus myosuroides) à des herbicides inhibiteurs de l’acétyle-coenzyme A carboxylase et à des herbicides inhibiteurs de l’acétolactate-synthase et recherche de gènes impliqués dans la résistance non liée à la cible. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences Vie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Délye C. GEAPSI

  5. Jarabo Trichard A. (2014). Effets des pratiques locales et du paysage sur des communautés en interaction : la prédation des adventices par les carabidae en semis direct. Thèse de Doctorat, Science Vie, Spécialité Agroécologie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Petit S., Co-Encadrant de thèse: Chauvel B. 234p. EcolDur

  6. Li Kim Khiook I. (2014). Induction de résistance de la vigne au mildiou : aspects coûts/bénéfices et impact d'une intensité lumineuse limitante. Thèse de Doctorat, Sciences de la Vie. Université de Bourgogne. Directeur de thèse : Adrian M., Co-encadrantes : Héloir M.-C., Trouvelot S. IPM

  7. Noguero M. (2014). Contribution de l'albumen au développement de la graine chez Medicago truncatula : caractérisation d'un facteur de transcription de type DOF exprimé dans l'albumen chalazal. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la vie. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Thompson R., Co-directrice: Gallardo K. 170p. GEAPSI

  8. Perronne R. (2014). Caractérisation de la structure fonctionnelle des communautés adventices dans les agroécosystèmes. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la Vie, Spécialité Ecologie. Dijon. Université de Bourgogne. Directrice de thèse: Gaba S., Co-encadrante: Le Corre V. 262p. EcolDur GEAPSI

  9. Peyret-Guzzon M. (2014). Etude moléculaire de la diversité des communautés et populations de champignons mycorhiziens à arbuscules (Glomeromycota). Thèse de Doctorat, Discipline Sciences Vie, Spécialité Ecologie Microbienne-Agroenvironnement. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Redecker D. 187p. IPM

  10. Tardy V. (2014). Lien entre la diversité microbienne, la stabilité des communautés microbiennes et le turnover des matières organiques du sol. Thèse de Doctorat. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Ranjard L. Co-directeur de thèse: Maron P.A. EcolDur (GenoSol)

  11. Trdá L. (2014). Identification et caractérisation du récepteur à la flagelline (VVFLS2) et recherche du récepteur aux chito-ologosaccharides chez la vigne. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la Vie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Daire X., Co-directeur de thèse: Poinssot B. 129p. IPM

  12. Vermue A. (2014). Contribution à l'évaluation multicritère des systèmes de culture en protection intégrée contre les adventices : cas des émissions de protoxyde d'azote. Thèse de Doctorat, Science Terre. Dijon. Université de Bourgogne. Directeurs de thèse: Nicolardot B., Hénault C. 122p. EcolDur

  13. Vivant A.-L. (2014). Persistance et adaptation de Listeria monocytogenes dans le sol : rôle du système de communication Agr. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la Vie, Spécialité Écologie Microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Piveteau P., Co-encadrant: Garmyn D. 195p. MERS

2013

  1. Betelli L. (2013). Développement et évaluation d'une méthode fondée sur la PCR temps réel pour la caractérisation des bioaérosols : application au groupe des actinomycètes. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences Vie. Vandoeuvre-lès-Nancy. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Hartmann A., Co-directrice: Géhin E. 252p. MERS

  2. Billiot B. (2013). Conception d’un dispositif d’acquisition d’images agronomiques 3D en extérieur et développement des traitements associés pour la détection et la reconnaissance de plantes et de maladies. Thèse de Doctorat sciences pour l’ingénieur et microtechniques, Spécialité Instrumentation et Information de l’Image. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Gouton P., Co-encadrant: Cointault F. 170p. EcolDur

  3. Lepinay C. (2013). Etude des interactions plantes-microbes et microbes-microbes, au sein de la rhizosphère, sous un aspect coûts-bénéfices, dans un contexte de variation environnementale. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la vie, Spécialité Ecologie microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Mougel C., Co-encadrant: Salon C. 262p. EcolDur GEAPSI

  4. Lienhard P. (2013). Evaluation agroécologique de systèmes de culture en zone tropicale humide. Cas de la mise en valeur agricole d'une savane herbacée acide (Plaine des Jarres, LAOS). Thèse de Doctorat en sciences de la vie, Discipline Agronomie-Ecologie microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Ranjard L. 184p. EcolDur (GenoSol)

  5. Locatelli A. (2013). Prévalence de pathogènes humains dans les sols français : Effet des facteurs pédoclimatiques, biologiques et du mode d'utilisation des sols. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la vie, Spécialité Ecologie microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Hartmann A., Co-encadrant de Thèse: Piveteau P. 136p. MERS

  6. Mézière D. (2013). Compromis biodiversité-nuisibilité des communautés adventices dans les systèmes de culture : développement d’une méthode de diagnostic combinant simulations et indicateurs. Thèse de doctorat. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Colbach N., co-encadrante: Granger S. 181p. EcolDur

  7. Molinier V. (2013). Diversité génétique et aromatique de la truffe de Bourgogne. Thèse de Doctorat, Sciences de la Vie, Spécialités Biologie Végétale et Biologie Évolutive. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Wipf D., co-encadrante: Gollotte A. 316p. IPM

  8. Ribalta F. (2013). Generation of homozygosity and genome fixation in pea (Pisum sativum L.). Thèse de Doctorat en co-tutelle internationale. The University of Western Australia. Co-directeurs : Erskine W., Finnegan P., Croser J., Ochatt S. GEAPSI

2012

  1. Abdallah C. (2012). Technical improvements for analysis of recalcitrant proteins by LC-MS: the mycorrhiza responsive membrane proteome as a case study. Thèse de Doctorat, Spécialité Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Co-Directeurs de thèse: Dumas-Gaudot E., Recorbet G., Renaut J. 330p. IPM

  2. Abid M. (2012). Ecological role of mycotoxins produced by Fusarium graminearum: consequences of the presence of deoxynivalenol (DON) in crop residues on the soil microflora and soil fauna. Thèse de Doctorat en Sciences de la Vie, Spécialité Écologie Microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Steinberg C. 204p. IPM

  3. Adam T. (2012). Etude de l’implication de l'endocytose à clathrine dans les réactions de défense déclenchées par la cryptogéine chez le tabac. Thèse de Doctorat, Spécialité Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Leborgne-Castel N. 124p.et 38 d’annexes. IPM

  4. Atif R.M. (2012). Dissecting the factors controlling seed development in the model legume Medicago truncatula. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences Vie. Spécialité Physiologie moléculaire des plantes et biotechnologie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse Ochatt S., Co-directeur Thompson R. 163p. GEAPSI

  5. Bonneau M. (2012). Échantillonnage adaptatif optimal dans les champs de Markov, application à l’échantillonnage d’une espèce adventice. Thèse de Doctorat, Spécialité Mathématiques appliqués. Castanet-Tolosan, Dijon. Université P. Sabatier de Toulouse. Directeurs de thèse: Sabbadin R., Peyrard N., Gaba S. 92p. EcolDur

  6. Boursault A. (2012). Caractérisation des relations trophiques entre composantes d'un agroécosystème : le cas de la prédation des graines d'adventices par les Carabidæ. Thèse de Doctorat, Discipline Agroécologie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Petit S. 227p. EcolDur

  7. Doidy J. (2012). The Medicago truncatula sucrose transporter family: sugar transport from plant source leaves towards the arbuscular mycorrhizal fungus. Thèse de Doctorat, Spécialité Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Directeurs de thèse: Schüßler A., Wipf D. 296p. IPM

  8. Elmaghrabi A.M. (2012). In vitro studies of salt and drought tolerance at the physiological, cellular and molecular levels in Medicago truncatula. Thèse de Doctorat en co-tutelle internationale, Spécialité Biosciences. Cardiff University, UK. Co-directeurs : Francis D., Rogers H., Ochatt S. 215p. GEAPSI

  9. Gard B. (2012). Processus écologiques et évolutifs influençant la colonisation de l'ambroisie (Ambrosia artemisiifolia L.) en France. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences Vie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse : Bretagnolle, F. Co-directeur de thèse: Laitung B. 171p. EcolDur

  10. Goyer M. (2012). Mécanismes cellulaires et moléculaires de l'interaction de C-albicans avec les cellules épithéliales intestinales : rôle des Tight junctions. Thèse de doctorat Sciences Vie. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Bonnin A., Coencadrement: Dalle F. MERS

  11. Hafeez F. (2012). Characterization of microbial communities in Technosols constructed for industrial wastelands restoration. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences Vie, Spécialité Ecologie Microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse : Philippot L. Co-directeur de thèse: Martin-Laurent F. 143p. EcolDur

  12. Hayek S. (2012). Mycorrhiza-induced resistance against Thielaviopsis basicola in the ornamental crop Petunia hybrida. Thèse de Doctorat, Discipline Biochemistry, Cellular and Molecular Biology. Dijon. Université de Bourgogne. Directeurs de thèse: Gianinazzi-Pearson V., Eckhard G. Co-directeur de thèse : Franken P. 135p. IPM

  13. Hijazi B. (2012). Development of 3D image acquisition system and image processing algorithms for the characterization of the ejection parameters of fertilizer granules. Thèse de doctorat en Instrumentation et informatique de l'image. Université de Bourgogne / Université de Gand en Belgique Directeur de thèse: Paindavoine M., Pieters J., Cointault F., Vangeyte J. 145p. EcolDur

  14. Koen E. (2012). Acteurs de l'homéostasie du fer chez Arabidopsis thaliana: caractérisation fonctionnelle de la nicotianamine synthase 4 et implications dans la résistance aux micro-orgnismes pathogènes. Thèse de Doctorat, Spécialité Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse : Wendehenne D. 245p. IPM

  15. Leplat J. (2012). Développement saprotrophe de Fusarium graminearum: rôle respectif de différents habitats naturels du champignon dans le processus d'infection du blé en Bourgogne; recherche d'indicateurs prédictifs du risque de fusariose. Thèse de Doctorat en Sciences de la Vie, Spécialité Écologie Microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeurs de thèse: Steinberg C., Mangin P. 303p. IPM

  16. Liu Y. (2012). Calcium-related fungal genes implicated in arbuscular mycorrhiza. Thèse de Doctorat, Discipline Microbiologie, Spécialité Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire. Wuhan (République Populaire de Chine). Huazhong Agricultural University et Université de Bourgogne. Directeurs de thèse: Zhao B., Gianinazzi-Pearson V., Co-directeur de thèse: van Tuinen D. 126p. IPM

  17. Manzoor H. (2012). Calcium signaling in plant defense: involvement of subcellular compartments and glutamate receptors. Thèse de Doctorat, Discipline Sciences de la Vie, Spécialité Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Garcia-Brugger A. 239p. IPM

  18. Zancarini A. (2012). Etude de l’intéraction plante-communautés microbiennes de la rhizosphère chez l’espèce modèle Medicago truncatula par une approche multidisciplinaire: contribution à la réflexion sur le pilotage des interactions par la plante. Thèse de Doctorat, Sciences de la Vie et de la Terre, Spécialités Ecophysiologie et Ecologie Microbienne. Dijon. Université de Bourgogne. Directeur de thèse: Munier-Jolain N. Co-directeurs de thèse: Mougel C., Salon C. 202p. GEAPSI EcolDur

12.2. Travaux encadrés: Masters 2


2015

  1. Ratchinskiy C. (2015). Réponses phénologiques et croissance comparées chez deux espèces adventices à large répartition géographique : le Chénopode blanc et l'Amarante réfléchie. Rapport de stage de master 2. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Laitung B., Scalone R. 25p. EcolDur

2014

  1. Boyer L. (2014). Infestation chez le pigeon biset (Columbia livia) en environnement urbain par différentes souches bactériennes pathogènes : prévalence dans la population et mise en lien avec le phénotype de l’hôte. Rapport de stage de Master 2, Master STS – ETE - Spécialité Biologie des Organismes et des Populations. Master 2. Université de Bourgogne. Encadrants: Bollache L., Moreau J., Hartmann A. 31p. MERS

  2. Faivre C. (2014). Comment l'apport de biochar impacte les communautés fongiques dans le sol d'une plantation d'hévéa : cas du nord-est de la thaïlande. Rapport de stage de Master 2. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Curmi P., Lesueur D. 60p. EcolDur (GenoSol)

  3. Harafa S. (2014). Recherche de critères phénotypiques et moléculaires discriminants des différentes espèces et sous-espèces du genre Pisum. Master IIR Master sciences de la vie, Biologie integrative des interactions plante microbe environnement Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant : Delaitre C. 38p. GEAPSI

  4. Martel J. (2014). Signalisation moléculaire des réponses immunes chez la plante Medicago truncatula - Rôle de la nutrition. Rapport de stage de Master II R - Signalisation Cellulaire et Moléculaire Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Jeandroz S., Truong H.-N. 27p. IPM

  5. Nassiri S. (2014). Etude du système de perception des chito--oligosaccharides chez la vigne et rôle dans l'immunité. Rapport de stage de Master II R Signalisation Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Poinssot B., Heloir M.C. 25p. IPM

  6. Pfister C. (2014). Étude de la régulation des calmodulines de Nicotiana tabacum par le monoxyde d’azote. Rapport de stage de Master II R - Signalisation Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Lamotte O. 25p. IPM

  7. Vasselon D. (2014). Rôle des histones désacétylases de type 2 dans le contrôle de l’immunité chez les plantes. Rapport de stage de Master II R - Signalisation Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Bourque S., Nicolas-Frances V. 25p. IPM

  8. Verzat V. (2014). Modélisation de la répartition des assimilats au sein du système racinaire chez le pois de printemps (Pisum sativum). AgroParisTech. Enseignant responsable du stage : Jullien, A. ; Maître de stage : Voisin, A-S. 57p. GEAPSI

  9. Wirsich M. (2014). Unravelling the effect of the transcription factor DOF1147 and of auxin on cell division and endoreduplication in developing seeds of the model legume Medicago truncatula. Rapport de stage de Bachelor Thesis en co-tutelle internationale. Hochschule Geisenheim University. Referents: Schröder M.B., Ochatt S. J. 81p. GEAPSI

2013

  1. Bardet E. (2013). Prévalence de gènes de résistances aux antibiotiques dans les communautés bactériennes de l'environnement : impact des systèmes de traitement d'eaux usées. Mémoire de Master II STS-ETEC, spécialité Biologie des organismes et des populations. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Hartmann A. 25p. MERS

  2. Cernay C. (2013). Caractérisation expérimentale de la variabilité phénotypique du système racinaire nodulé de génotypes contrastés de pois (Pisum sativum L.), en phase végétative et en milieu de croissance non azoté. Rapport de stage d’École d'ingénieur, Master 2 Sciences et Technologies du Vivant et de l’Environnement et d’Ingénieur en Agriculture. Angers. École Supérieure d’Agriculture. Encadrant: Voisin A.-S. 84p. GEAPSI

  3. Fossot C. (2013). Étude de la colonisation racinaire par la bactérie pathogène ubiquiste Listeria monocytogenes : rôle de l'environnement biotique et du régulateur transcriptionnel agra. Mémoire de stage de Master II STS-ETE, spécialité Biologie des organismes et des populations. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Piveteau P. 29p. MERS

  4. Haddad M. (2013). Introduction à l’étude de l’interaction de Candida albicans avec les cellules entérocytaires Caco-2. Rapport de stage de Master 2. Université de Bourgogne. Encadrant: Sautour M. 27p. MERS

  5. Helbecque C. (2013). Contribution à l'étude des 5-énol-pyruvylshikimate-3 phosphate synthases (EPSP synthase) de Nicotiana tabacum. Rapport de stage de Master II Biologie Intégrative des Intéractions Plante Microbe Environnement. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Lamotte O. 21p. IPM

  6. Issanchou C. (2013). Connectivité d’un paysage agricole et processus de dispersion des adventices. Approche par l’analyse de la similarité des communautés. Rapport de stage de Master II, Master STS - ETE Spécialité Biologie des Organismes et des Populations. Université de Bourgogne. Encadrant : Ricci, B. 25p. EcolDur

  7. Leclercq P. (2013). Etude de la régulation du facteur de transcription ATB2 chez Medicago truncatula. Rapport de stage Master II B2IPME. Université de Bourgogne. Encadrant : Ochatt S. J., Vernoud V. 21p. GEAPSI

  8. Leprêtre L. (2013). Stratégies de déplacement en milieu inconnu : cas d'étude chez trois espèces de coléoptères. Mémoire de Master II STS - ETEC, spécialité Biologie des organismes et des populations. Université de Bourgogne. Encadrants: Bohan D., Petit.S. 27p. EcolDur

  9. Perrin E. (2013). Analyse fonctionnelle de l’évolution des communautés adventices entre 1970 et 2000. Mémoire de Master II STS - ETEC, spécialité Biologie des organismes et des populations. Université de Bourgogne. Encadrants: Petit S., Gaba.S., Fried G. 42p. EcolDur

  10. Petit C. (2013). La tuberculose bovine en Côte-d’Or : Statut épidémiologique et rôle du blaireau (Meles meles). Rapport de stage de Master 2, Spécialité Biologie des Organismes et des Populations. Université de Bourgogne, AgroSup. Encadrants: Bollache L., Hartmann A. 30p. MERS

  11. Roffi R. (2013). Potentiel de résistance biotique des communautés herbacées face à l’envahissement d’Ambrosia trifida L. en France. Rapport de stage de Master II. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Laitung B., Chauvel B. 27 p. EcolDur

  12. Sadaoui A. (2013). Bases génétiques de la réponse aux contraintes de l’agroécosystème chez les plantes adventices (« mauvaises herbes »): Niveau d’expression de gènes impliqués dans la réponse au stress herbicide. Rapport de stage de Master II. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant : Délye C. 39 p. GEAPSI

  13. Tognite F.M. (2013). Implémentation et évaluation du modèle de culture de pois (Pisum sativum L.) AFISOL sous la plate-forme logicielle RECORD. Rapport de stage de Master II Master Compétences Complémentaires en Informatique. Université Paris Sud. Encadrant : Larmure A. 25p. GEAPSI

  14. Toulouse C.V. (2013). Conception d’un système d’acquisition de séquences d’images basé sur le Shape from Focus. Mémoire de Master 2, EVA Master. Université de Bourgogne et Nicéphore Cité. Encadrants: Cointault F., Billiot B. 34p. EcolDur

2012

  1. Baraton A. (2012). Les variétés de melon résistantes à la fusariose favorisent-elles dans leur rhizosphère la multiplication de souches pathogènes agressives? Rapport de stage de Master II STS-ETE, spécialité Biologie des organismes et des populations. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Steinberg C., Aimé S., Olivain C. 22p. IPM

  2. Barbier E. (2012). Caractérisation génotypique et le phénotypique de souches de Rhizobia par rapport à leur capacité à réduire le protoxyde d’azote (N2O), puissant gaz à effet de serre. Rapport de stage de Master II Aliments, Microbiologie, Assurance qualité, spécialité : Microbiologie appliquée à l'agroalimentaire et à l'agroenvironnement. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Revellin C. 28p. MERS

  3. Belkacem N. (2012). Etude de l’adhérence de Candida albicans sur un support type verre et sur cellules CACO-2 et TR-146. Rapport de stage de Master II. Dijon. Université de Franche Comté. Encadrants: Sautour M., Dalle F. 15p. MERS

  4. Bourgeois E. (2012). Evaluation de la robustesse technique et scientifique d'un bioindicateur de la qualité microbiologique du sol, la Biomasse Moléculaire Microbienne. Rapport de stage de Master II Aliments, Microbiologie, Assurance qualité, spécialité: Microbiologie appliquée à l'agroalimentaire et à l'agroenvironnement. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Ranjard L., Dequiedt S., Maron P. A. 25p. EcolDur (GenoSol)

  5. Brulé D. (2012). Etude du mode d’action de l’acide β-aminobutyrique (BABA), un stimulateur des réactions de défense, sur l’homéostasie du fer chez Arabidopsis thaliana. Rapport de stage de Master II R BBCM. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Besson-Bard A. 25p. IPM

  6. Bruyère R. (2012). Impact de la modulation de la réponse inflammatoire pulmonaire et systémique de l'hôte mediée par Toll-Like Receptor 2 dans un modèle animal de pneumopathie acquise sous ventilation mécanique à Staphylococcus aureus. Rapport de stage de Master II. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Charles P. E. MERS

  7. Chambolle J. (2012). La diversité des communautés végétales des forêts alluviales de l’Allier est-elle affectée par l’invasion de l’Érable négundo, du Robinier faux-acacia et de la Renouée de Bohême ? Rapport de stage de Master II. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Fumanal B., Laitung B., Le Henaff PM., Boullet V. 31p. EcolDur

  8. Darsonval M. (2012). Etude du système AGR par caractérisation de mutants de Listeria monocytogènes. Rapport de stage de Master II. Recherche Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Garmyn D., Piveteau P. 29p. MERS

  9. Dolhem J. (2012). Estimation de la densité du Blaireau (Meles meles) en Côte d’Or au regard du risque de transmission de la tuberculose bovine. Rapport de stage de Master 2, Spécialité Biologie des Organismes et des Populations. Université de Bourgogne, AgroSup. Encadrants: Bollache L., Payne A. 27p. MERS

  10. Drouhin C. (2012). Diversité fonctionnelle au sein des communautés de plantes adventices: effet de la rotation et du type de culture. Université de Bourgogne. Encadrants: Gaba S., Le Corre V., Perronne R. 28p. EcolDur GEAPSI

  11. Erassoff D. (2012). Nutrition azotée des plantes en interactions avec les communautés bactériennes du sol impliquées dans le cycle de l'azote. Mémoire de Master II. Université de Bourgogne. Encadrant: Mougel C., Moreau D. 32p. EcolDur

  12. Fanjas-Mercère T. (2012). Rôle de la diversité fonctionnelle des communautés végétales sur leur résistance à l’invasion par l’Ambroisie à feuilles d’Armoise (Ambrosia artemisiifolia L.). Rapport de stage de Master II. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrants: Laitung B., Gard B. 31p. EcolDur

  13. Fourrey A. (2012). Le mode de nutrition azotée du Pois (Pisum sativum) induit-il une modulation de sa réponse à un déficit hydrique du sol ? Rapport de stage de Master II Master STS – ETE - Spécialité Biologie des Organismes et des Populations. Université de Bourgogne. Encadrant : Prudent M. 25p. GEAPSI

  14. Garreau E. (2012). Etude de l'interface fonctionnelle entre plante et champignon mycorhizogène à arbuscules : caractérisation fonctionnelle de transporteurs putatifs de sulfate chez Medicago truncatula. Rapport de stage de Master II Sciences, Technologies, Vie, Terre et Santé ; Mention « Biologie Santé » ; Spécialité « Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire » ; option " Physiologie Moléculaire Végétale". Université de Bourgogne. Encadrants : Bonneau L., Casieri L., van Tuinen D. 29p. IPM

  15. Grandperret V. (2012). Etude de la régulation d'une histone déacetylase de type 2 dans le contexte des réactions de défense des plantes. Rapport de stage de Master II R BBCM. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Bourque S. 25p. IPM

  16. Han S. (2012). Acquisition d’images multimodales pour la détection précoce de maladies sur feuilles. Mémoire de Master 2 «Vision - Image Intelligence Artificielle – Multimédia» parcours Vision Industrielle. Université de Bourgogne et Nicéphore Cité. Encadrant: Cointault, E. 60p. EcolDur

  17. Maurel A. (2012). Etude du rôle des jonctions serrées dans l’interaction de Candida albicans avec les cellules entérocytaires Caco-2. Rapport de stage de Master II. Dijon. Université Paris 6. Encadrants: Dalle F., Goyer M., Bon F. 41p. MERS

  18. Millet L. (2012). Détermination des domaines vitaux et taux de contact chez le blaireau, Meles meles en présence de zones à bovins dans un contexte de tuberculose bovine. Rapport de stage de Master 2, Spécialité Biologie des Organismes et des Populations. Université de Bourgogne, AgroSup. Encadrants: Bollache L., Payne A. 52p. MERS

  19. Pierre C. (2012). Impact de huit plantes invasives sur des communautés végétales de la région méditerranéenne. Rapport de stage de Master II. Angers. AgroSup Dijon. Encadrants: Fried G., Laitung B. 51p. EcolDur

  20. Trapet P. (2012). Les protéines S-nitrosylées lors des réponses de défense des plantes. Cas de la protéine CDC48 et de l’EPSP Synthase. Rapport de stage de Master II R BBCM. Dijon. Université de Bourgogne. Encadrant: Lamotte O. 25p. IPM

12.3. Habilitations à diriger les recherches


2015

  1. Barnard R. (2015). Réponses de la plante et des microorganismes du sol aux changements environnementaux. Dijon. Université de Bourgogne. EcolDur

2014

  1. Chauvel B. (2014). Apports de l'agronomie et de l'écologie pour une gestion intégrée des communautés de mauvaises herbes. Dijon. Université de Bourgogne. EcolDur

  2. Gallardo-Guerrero K. (2014). Biologie des graines : des espèces modèles aux légumineuses cultivées. Dijon. Université de Bourgogne. GEAPSI

  3. Maron P.A. (2014). Dynamique, diversité et régulation des communautés microbiennes impliquées dans les cycles du carbone et de l'azote dans le sol. Dijon. Université de Bourgogne. EcolDur (GenoSol)

2013

  1. Gaba S. (2013). Ecologie des communautés dans les agroécosystèmes: comment maintenir la biodiversité adventices et la production agricole? Dijon. Université de Bourgogne. EcolDur

12.4. Bases de données

2013



12.5. Rapports de grands projets internationaux

2013


  1. Revellin C. (2013). Technical committee of the project SYMGES. BASF SE, Limburgerhof, Allemagne. Rapport final de contrat de recherche INRA (communication orale invitée, 46 slides). MERS

12.6. Rapports de programmes et d’expertises nationaux ou régionaux


2014

  1. Haut Conseil des Biotechnologies, Bertheau Y., Boireau P., Bourguet D., Chauvel B., Coleno F.-C., Desquilbet M., Guerche P., Klonjkowski B., Lereclus D., Renard M., Regnault-Roger C., Vaissière B., Vilotte J.L. (2014). Avis en réponse à la saisine du 7 novembre 2013, de Madame Marie-Christine Blandin, relative à l’article de Snell et al. (Food and Chemical Toxicology, 2012). 10p. EcolDur

  2. Litrico I., Bonnin I., Duc G., Enjalbert J., Goldringer I., Rolland B., Ronfort J., Millot D. (pour partie bibliométrie) (2014). Agroécologie, Génétique végétale et Amélioration des plantes. Rapport d’analyse Département BAP, INRA. 47p. GEAPSI

2013

  1. Reboud X., participant au Groupe de travail national «Adventices» pour le Ministère de l'Agriculture (2013). Quelle place pour les adventices dans l’épidémiosurveillance ? Rapport au Comité National d’Epidémiosurveillance. 98p. EcolDur

2012

  1. Duc G., Blanchard S., Deytieux V., Hénault C., Lecomte C., Petit M.-S., Bernicot M.-H., Bernus M., Bizouard F., Blanc N., Blondon A., Blosseville N., Bonnin E., Bois B., Castel T., Challan-Belval C., Coulon C., Cuccia C., Delattre M., Dobrecourt J.F., Druot L., Dumas M., Geloen M., Hayer F., Humeau F., Huot E., Jeuffroy M.-H., Killmayer M., Larmure A., Lelay D., Leseigneur A., Mabire J.B., Mangin P., Marette A., Marget P., Million G., Nemecek T., Payot B., Raynard L., Robin P., Ronget D., Richard Y., Vaccari V., Vermue A., Villard A., Villery J., Vivier C. (2012). PSDR Profile: Potentiels et leviers pour developper la production et l'utilisation des protéagineux dans le cadre d'une agriculture durable en Bourgogne. (Plaquette de présentation PSDR - Pour et Sur le Développement Régional). 4p. GEAPSI EcolDur

  2. Wipf D., Wendehenne D. (2012). Evaluation des projets intégrés de recherche innovation (PARI). Fiche projet intégré AGRALE 8 - Interactions Plantes- Microorganismes : Mécanismes et Applications. IPM
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